Od 1928 poświęcił się głównie pracy pedagogicznej, w latach 1928-1932 uczył w Szkole Rolniczej w Starej Wsi koło Siedlec. 13 lutego 1933 r. Ministerstwo Wyznań Religijnych i Oświecenie Publicznego mianowało Niedbalskiego dyrektorem Powiatowej Szkoły Rolniczej w Wacynie koło Radomia. Szkołą kierował ponad 6 lat, ale ten krótki czas wystarczył by Wacyn stał się jednym z najbardziej znanych ośrodków oświaty rolniczej w Polsce. W 1938 objął funkcję prezesa w Zarządu Komisji Nauczycielstwa Szkolnictwa Rolniczego. Po wybuchu II wojny w październiku 1939 otrzymał od władz okupacyjnych zwolnienie z zajmowanego stanowiska dyrektora szkoły w Wacynie, podjął pracę w Spółdzielni Rolniczo-Handlowej w Radomiu. Pozostawał w łączności z byłym marszałkiem Sejmu Maciejem Ratajem. 21 stycznia 1941 aresztowany przez gestapo w Radomiu za działalność konspiracyjną, następnie przewieziony wraz z innymi więźniami do Skarżyska Kamiennej, gdzie był przez miesiąc przesłuchiwany i torturowany. 24 lutego 1941 wysłany i osadzony w obozie koncentracyjnym w Auschwitz (nr obozowy 10507), gdzie zginął 14 marca 1941.