Posada ta skończyła się jednak bardzo szybko, ponieważ chciano jej przypisać defraudację, która według niej nie miała miejsca. Przeniosła się do Kolonii, gdzie została aresztowana przez Anglików. Salvequart, która już od dłuższego czasu znajdowała się na liście poszukiwanych armii brytyjskiej, została doprowadzona do „Civil Internment Camp“ w Paderborn-Staumühle.
5 grudnia 1946 została postawiona przed brytyjskim Trybunałem Wojskowym w Hamburgu (był to pierwszy proces załogi Ravensbrück). Podczas postępowania sądowego twierdziła, że jej działalność ograniczała się do wypełniania aktów zgonu. Jednak liczni świadkowie podważyli wiarygodność jej wyjaśnień. 3 lutego 1947 została z jedenastoma współoskarżonymi skazana za swoje zbrodnie na karę śmierci. Salvequart wystąpiła z prośbą o ułaskawienie, twierdząc że ukradła plany rakiet V2 produkowanych w Ravensbrück przed 1944, w celu przekazania ich Brytyjczykom. Czasowo wstrzymano wykonanie wyroku (pozostałych oskarżonych skazanych na śmierć powieszono 2 i 3 maja 1947), by rozpoznać jej prośbę. Ostatecznie prośba ta została odrzucona i Vera Salvequart została powieszona przez kata Alberta Pierrepointa 26 czerwca 1947 w więzieniu Hameln.