Gniew Khana Dr. Marcus pracowała nad Projektem Genesis, dzięki któremu za pomocą specjalnej matrycy można było w krótkim czasie przetworzyć martwe planety, zamieniając je w żywe, pokryte zielenią światy. Niestety, jak zauważył doktor McCoy, torpeda Genesis użyta wobec świata zaludnionego zabiłaby i zniszczyła pierwotną populację w procesie terraformingu. W niewłaściwych rękach projekt Genesis mógłby stać się potężną bronią, toteż Kirk jak najszybciej wyruszył w drogę wiedząc doskonale, że Gwiezdna Flota nie zamierza ani przejąć projektu ani użyć go jako broni.
Postacią pragnącą zdobyć dostęp do projektu był Khan Noonien Singh, stary wróg Kirka, który przejął kontrolę nad okrętem USS Reliant by za jego pomocą zdobyć torpedę Genesis. Reliant podstępnie zaatakował Enterprise, ciężko uszkadzając go i pozbawiając głównej mocy. Ciężko uszkodzony Enterprise zdołał jednak zgubić Relianta. Ostatecznie oba okręty starły się ponownie w mgławicy Mutara, której właściwości wyrównały szansy tego pojedynku, pozbawiając obu oponentów osłon oraz ograniczając możliwości ich sensorów. Kirk za poradą Spocka wykorzystał słabość Khana przeciwko niemu i Enterprise zdołał zaatakować Relianta od tyłu i uszkodzić go trafieniami torped fotonowych.