W 1965 powrócił do Stanów Zjednoczonych. W latach 1965–1979 pracował w na Uniwersytecie w Detroit, najpierw na Wydziale Historycznym, następnie na Wydziale Studiów Religioznawczych, którym kierował w latach 1976-1979. W latach 1979–2006 pracował w Weston School of Theology w Cambridge (Massachusetts). Od 2006 był profesorem historii Kościoła na Wydziale Teologicznym Uniwersytetu Georgetown. W czerwcu 2020 przeszedł na emeryturę i zamieszkał w jezuickiej wspólnocie Saint Claude de la Colombiére w Baltimore.
Uczestniczył w 32 (1974-1975) i 33 (1983) Kapitule Generalnej swojego zakonu.
Od 1995 był członkiem Amerykańskiej Akademii Sztuk i NaukFather John W. O’Malley, od 1997 należał do Amerykańskiego Towarzystwa Filozoficzne, w latach 2010-2016 był jego wiceprzewodniczącymAmerican Philosophical Society Member History. W 1990 był przewodniczącym American Catholic Historical AssociationACHA Newsletter Fall 2022, w latach 1998-2000 przewodniczącym Renaissance Society of AmericaRenaissance Society of America. In Memoriam.