Po rozwiązaniu Armii Krajowej nie zdecydował się na ujawnienie i pozostał w konspiracji, zaczął się posługiwać fałszywym nazwiskiem Czesław Chmielewski. Na polecenie Stefana Szmakfefera podjął działania umacniające struktury podziemia antykomunistycznego i dostosowywanie go do długotrwałego działania w warunkach konspiracji. Nowe struktury początkowo funkcjonowały jako Samoobrona Społeczna, a od jesieni 1945 r. jako Ruch Oporu Armii Krajowej.
Jako komendant Inspektoratu Mazowieckiego ROAK rozpoczął tworzenie komórek informacyjno-wywiadowczych prowadzących działalność w zakresie wywiadu społecznego, gospodarczego i politycznego. Ograniczył liczebność tych struktur, kładł duży nacisk na ścisłą konspirację działalności. Dzięki jego działaniom zostały pozyskane radiostacje, które miały służyć utrzymaniu łączności z polskimi władzami na uchodźstwie. Przyczynił się do wydania „Biuletynu Mazowieckiego”, prasowego organu inspektoratu. Zalecał swym podwładnym przenikanie do struktur Urzędu Bezpieczeństwa Publicznego i Milicji Obywatelskiej aby docierać do informacji nt. sił radzieckich stacjonujących w Polsce oraz funkcjonowania komunistycznych organów bezpieczeństwa.