Mogą jednak co drugi dzień spać z innymi, poszczególne osobniki różnią się tu między sobą. Za dziennego spoczynku mikruski malutkie mogą zapadać w torpor, co pozwala im zaoszczędzać energię. Nie mają natomiast w zwyczaju zapadać w torpor sezonowy, spotykany u niektórych innych gatunków mikruska. Odkryto pewne różnice pomiędzy samcami i samicami. Te ostatnie dłużej sypiają w tym samym miejscu. Samce natomiast rozlokowują swe schronienia na szerszym obszarze. W otoczeniu innych przedstawicieli swego gatunku spędza mikrusek malutki 15% czasu, na zachowania społeczne przypada od 7 do 8%, najczęściej kontaktuje się z osobnikami płci przeciwnej. Obserwowano zachowania agonistyczne, jak pościgi, chwytanie, gryzienie.

Cykl życiowy Podejrzewa się, że mikrusek malutki rozmnaża się promiskuitycznie. Wskazuje na to wielkość jąder, pozostawianie w drogach rodnych samic czopów nasiennych (sperm plug) i dymorfizm płciowy w wielkości. Samica z młodym to jedyny rodzaj grupy spotykany w przypadku tego gatunku. Długość pokolenia 5,6 roku. W zbadanej populacji z Kirindy było 2 razy więcej samców niż samic, mimo że żadne dane nie wskazują na większą umieralność samic. Mikrusek malutki należy do mikrusków najpóźniej zaczynających sezon godowy, wraz z mikruskami kasztanowatym, rdzawym i karłowatym, a w przeciwieństwie choćby do bongolaweńskiego.