Pod koniec 1942 roku brygada przeniesiona zostaje do Iraku. Ks. Joniec zostaje naczelnym kapelanem 3. Dywizji Strzelców Karpackich w Mosulu. W czerwcu 1943 roku utworzono 1 Korpus Polski pod dowództwem gen. Władysława Andersa. Ks. Joniec bierze udział jako kapelan w kampanii włoskiej. Podczas walk o Monte Cassino pracował jako pomocnik sanitariuszy, z narażeniem życia pomagając żołnierzom, za co został uhonorowany Krzyżem Walecznych. W 1945 roku wziął udział w gaszeniu pożaru Bazyliki w Loreto. Z inicjatywy ks. Jońca powstaje Pomnik 3. Dywizji Strzelców Karpackich na wzgórzu 593, odsłonięty 18 lipca 1945 roku. W 1946 roku ks. Joniec wraz z żołnierzami trafił do Wielkiej Brytanii, gdzie nadal pełnił obowiązki duszpasterza wojskowego. Po rozwiązaniu 3. Dywizji w 1947 roku zdecydowała się na powrót do Polski. Przypłynął do Gdyni w stopniu podpułkownika 13 czerwca 1948 roku.