Po rozwiązaniu armii czechosłowackiej rozpoczął prace jako urzędnik w Wyższym Urzędzie Cen. W tym czasie przystąpił do konspiracyjnej organizacji wojskowej Obrona Narodu oraz w cywilnej organizacji konspiracyjnej Komitecie Petycyjnym „Pozostaniemy wierni”, gdzie był w pierwszym kierownictwie tej organizacji. Na przełomie 1939/1940 roku gestapo rozbiło to kierownictwo, lecz on sam uniknął aresztowania. Ukrywał się u znajomych w Modřanach, skąd na początku 1940 roku wyjechał do Francji.
Wstąpił tam do oddziałów czechosłowackich, używał tam nazwiska Znamenáček. W marcu 1940 roku został zastępcą dowódcy 1 Czechosłowackiej Dywizji Piechoty. Po ataku na Francję, z powodu choroby dowódcy dywizji, pełnił obowiązki jej dowódcy. Następnie na czele 1 i 2 pułku piechoty wziął udział w walce, a następnie kierował ewakuacją dywizji do Wielkiej Brytanii.