Przez ponad 30 lat, w latach 1950–1984 wykładał na Akademii Sztuk Pięknych w Warszawie, gdzie wychował dziesiątki pokoleń studentów. Pedagogiczną karierę ukoronował w 1970 roku tytułem profesora oraz kierownika Katedry Malarstwa i Rysunku na Wydziale Grafiki warszawskiej ASP.
Jest laureatem licznych nagród w kraju i zagranicą. Jest członkiem Związku Polskich Artystów Plastyków (ZPAP). Jest pełnoprawnym członkiem korespondentem (od 1967 roku) oraz jest konsyliarzem (od 1968 roku) w International Arts Guild w Monte Carlo. Miał kilkadziesiąt wystaw indywidualnych, wziął udział w kilkuset wystawach zbiorowych.
Prace Stanisława Żółtowskiego znajdują się m.in. w zbiorach: Muzeum Narodowego w Warszawie, Muzeum Historycznego Miasta Stołecznego Warszawy, Muzeum Żydowskiego Instytutu Historycznego w Warszawie, Muzeum Akademii Sztuk Pięknych w Warszawie, Muzeum Okręgowego w Lublinie, Muzeum Mikołaja Kopernika w Toruniu, Muzeum Warmii i Mazur w Olsztynie, Muzeum Pomorza Środkowego w Słupsku, Ministerstwa Kultury i Sztuki czy Stołecznego Biura Wystaw Artystycznych, obecnie Narodowa Galeria Sztuki Zachęta w Warszawie, oraz w kolekcjach prywatnych w kraju i zagranicą m.in.: w Austrii, Australii, Argentynie, Belgii, Chinach, Finlandii, Francji, Holandii, Grecji, Iraku, Japonii, Kanadzie, Monako, Niemczech, Nowej Zelandii, Rosji, Szwajcarii,