Podczas pobytu w Wiedniu pracowała również dla Wiener Werkstätte i zaprojektowała trzy płaskorzeźby na główną fasadę Burgtheater. Również w Wiedniu namalowała dwa spośród swoich najważniejszych dzieł, Adolescentia i Ver Sacrum. Pracując w Wiedniu, nie przestała czerpać inspiracji z motywów i tematów typowych dla sztuki rosyjskiej, przetwarzając je w duchu austriackiego modernizmu. Utrzymywała również kontakty z rosyjską grupą Mir iskusstwa, sprzyjając rozwojowi kontaktów między rosyjskimi kołami artystycznymi a kręgiem austriackiej awangardy.
Życie i twórczość w Hamburgu mały|Kopia Losu kobiety wystawiona w parku miejskim w Hamburgu W 1907 roku małżeństwo przeniosło się do Hamburga po tym, jak Richard Luksch został profesorem w Szkole Sztuk i Rzemiosła. Tam Luksch-Makowsky rozpoczęła pracę nad rzeźbą Frauenschicksal (Los kobiety), która, jak sugerowali historycy sztuki, obrazuje trudność łączenia ról matki i artystki, a także zapowiada jej przyszłe zmagania jako samotnej matki. Artystka nadal utrzymywała kontakty z artystami wiedeńskimi oraz petersburskimi, nie weszła natomiast, w odróżnieniu od męża, do hamburskiego środowiska twórczego. Jej styl malowania uległ kolejnym zmianom – linie uprościły się, pojawiły się intensywniejsze barwy i szersza gama kolorystyczna.