Wkrótce potem w wyniku sporu co kierunku muzycznego z zespołu odszedł Kooper zabierając ze sobą Katza. Jeszcze w tym samym roku założył jazz-rockowy zespół Blood, Sweat and Tears, który po podpisaniu kontraktu z Columbia Records pod koniec 1967 roku wydał w roku następnym swój debiutancki album, The Child Is Father to the Man. Później, na skutek tarć personalnych w zespole i nacisków ze strony wytwórni, która chciała bardziej komercyjnego brzmienia, Kooper odszedł i z tego zespołu. The Blues Project tymczasem wydał swój trzeci album, Live at Town Hall, skompilowany z taśm zarejestrowanych na żywo i z nagrań studyjnych. Blumenfeld i Kulberg nagrali jeszcze pod szyldem The Blues Project czwarty album, po czym utworzyli zespół Seatrain. The Blues Project działalność wznawiał w latach 70., w różnych składach. W 1971 roku do zespołu dołączył Blumenfeld, aby nagrać album Lazarus, a w 1972 powrócił Flanders aby zarejestrować album, zatytułowany nazwą zespołu. W 1973 roku w składzie zespołu pojawił się Kooper (album Reunion In Central Park).
Zespół jeszcze kilkakrotnie reaktywował się w latach 80. i 90. W 2002 roku zmarł Kulberg.