Podejmował starania dla poprawienia stanu oświaty. W schyłku lat 40. XIX wieku wydarzenia polityczne skłoniły go do zajęcia się naukami przyrodniczymi. Na początku 50. XIX wieku zaczął publikować, w rocznikach Śląskiego Towarzystwa Kultury Ojczystej, informacje o swoich odkryciach. A od 1856 został członkiem korespondentem tego towarzystwa. Hilse swoje prace badawcze prowadził w okolicach Strzelina. Początkowo oznaczał proste, znane powszechnie rośliny – z czasem zajął się roślinami wymagającymi użycia mikroskopu. Hilse wyróżnił, szereg nowych gatunków glonów. Swoimi badaniami systematycznie dzielił się z wydawcą zbiorów glonów europejskich – Rabenhorstem.
W 1863 przeprowadził się do Wrocławia gdzie podjął pracę w nowo otwartej szkole średniej. Jego stan zaczął się pogarszać w 1867 roku. Zmarł 29 marca 1871 we Wrocławiu po dwóch latach kuracji w Karlowych Warach.
Działalność naukowa Jego główną pracą jest Beiträge zur Algenkunde Schlesiens wydana w 1865, w której omówił glony z okolic Wrocławia i innych miejscowości, jakie odwiedzał podczas częstych wycieczek.