Łączna powierzchnia tej strefy wynosi 14 793 ha (25,18% powierzchni CHKO)”.
Niewymienione dotąd części CHKO o łącznej powierzchni 39 326 ha (66,95% terytorium CHKO) znajdują się w strefie D, w której obowiązuje podstawowy, 2. stopień ochrony. Celem istnienia tak zdefiniowanej strefy jest „ochrona i zachowanie rozproszonych ekosystemów ważnych z punktu widzenia różnorodności biologicznej i stabilności ekologicznej oraz charakterystycznego wyglądu krajobrazu z określonymi formami osadnictwa”.
Granice CHKO pokrywają się także z granicami obszaru specjalnej ochrony ptaków (SPO) Horná Orava (SKCHVU008) ustanowionej w 2005 roku w ramach programu Natura 2000. W jej granicach znajduje się też szereg obszarów mających znaczenie dla Wspólnoty (SCI), z których największe to: Rašeliniská Oravskej kotliny (SKUEV0057; 839,56 ha), Pilsko (SKUEV0188; 701,07 ha) i Babia hora (SKUEV0189; 504,13 ha). Zbiornik Orawski wraz z otaczającymi je torfowiskami został też objęty ochroną w ramach konwencji z Ramsar (jednostka 933;