Atak Harrison w 1999 roku przeżył atak nożem przez chorego psychicznie mężczyznę, który zadał mu 40 ciosów. Napastnik został powstrzymany, kiedy został uderzony w głowę lampą przez żonę muzyka.

Choroba i śmierć Był nałogowym palaczem papierosów. W sierpniu 1997 zdiagnozowano u niego początki raka krtani, jednak dzięki szybkiemu zastosowaniu radioterapii zahamowano rozwój choroby. W 2001 nastąpiły przerzuty raka najpierw do płuc, następnie do mózgu.

Zmarł 29 listopada 2001. Jego prochy zostały wrzucone do rzeki Ganges w Waranasi.

Życie prywatne Był dwukrotnie żonaty. Na planie filmu Noc po ciężkim dniu w 1964 poznał aktorkę Pattie Boyd, z którą zaręczył się 25 grudnia 1965 i którą poślubił 21 stycznia 1966 w urzędzie stanu cywilnego w Esher. Małżeństwo rozpadło się w czerwcu 1974. mały|Harrison i Boyd opuszczają urząd stanu cywilnego po ślubie (1966) W trakcie trwania małżeństwa z Boyd, Harrison miał romans z żoną Ringo Starra.

W późniejszym czasie zawarł drugi związek małżeński z Olivią Trinidad Arias, z którą miał swego jedynego syna, Dhaniego.