Na jej podstawie, jak również pozytywnych recenzji całości dorobku naukowego po pomyślnym zaliczeniu kolokwium habilitacyjnego przed Radą Wydziału Nauk Społecznych U. Śl. (12 marca 2002 r.) i zatwierdzeniu decyzji Rady przez Centralną Komisję Kwalifikacyjną do spraw Stopni i Tytułu Naukowego (24 czerwca 2002 r.) uzyskał stopień doktora habilitowanegoJarosław Indyk, Artur Jach-Chrząszcz, Jarosław Jastrzębski, Działalność naukowa Profesora Romana Kochnowskiego, w: Polityka - wojskowość - bezpieczeństwo. Księga jubileuszowa z okazji 40-lecia działalności naukowej Profesora Romana Kochnowskiego (red.) Jarosław Jastrzębski, Tomasz Skrzyński, Kraków: Wydawnictwo Naukowe UP, 2023, s. 14. ..
Od 2001 roku w ramach tzw. II etatu był zatrudniony m.in. na Uniwersytecie Opolskim (2001-2002), na Akademii Techniczno-Humanistycznej w Biesku Białej (2002-2004) oraz Uniwersytecie Ekonomicznym w Katowicach (2011-2013). Roman Kochnowski współpracuje ponadto z licznymi ośrodkami zagranicznymi, m.in. z wiedeńskim Institut für den Donauraum und Mittleleuropa, Europäische Akadermie der Zivilgesellschaft w Eggenburgu (Austria) oraz Zentrum für Militärgeschichte der Bundeswehr w Poczdamie i All Souls College Oxford University. W semestrze letnim roku akademickiego 2011/2012 był visting profesor w Katedrze Komunikacji Społecznej Uniwersytetu im.