W 1994 roku Yousef i Muhammad zaczeli testować zabezpieczenia lotnisk. Yousef zarezerwował lot między portem lotniczym Hongkong-Kai Tak a portem lotniczym Tajpej-Taiwan Taoyuan. Muhammad zarezerwował lot między portem lotniczym Manila a portem lotniczym Seul-Gimpo. Obaj już wcześniej przerobili 14 butelek płynu do soczewek kontaktowych na butelki zawierające nitroglicerynę, która była łatwo dostępna na Filipinach. Yousef przykleił do łuku stopy metalowy pręt, który miał posłużyć jako detonator. Obaj nosili biżuterię i ubrania z metalowymi elementami, aby zmylić ochronę lotniska. Aby poprzeć swoje twierdzenie, że spotykali się z kobietami, spakowali prezerwatywy do swoich toreb.

8 grudnia 1994 Yousef wprowadził się do apartamentów Doña Josefa pod pseudonimem „Najy Awaita Haddad” i podał się za Marokańczyka.

Yousef zarezerwował pokój 603 z wyprzedzeniem. Złożył depozyt w wysokości 80 000 peso i dołożył 40 000 peso z góry, zanim wjechał windą do pokoju.

Spiskowiec o imieniu Abdul Hakim Murad udał się do Manili z Yousefem i zatrzymał się w tym samym mieszkaniu.

Apartamenty znajdują się w dzielnicy Malate, 200 metrów od Nuncjatury Apostolskiej na Filipinach i 500 metrów od komisariatu policji.