Flotylli U-Bootów, operując z Kilonii.

Pierwszy rejs bojowy 1 kwietnia 1941 roku U-556 osiągnął gotowość bojową, pozostając nadal w składzie 1. Flotylli U-Bootów. 1 maja okręt wyszedł z Kilonii, udając się na swój pierwszy wojenny patrol. 6 maja w pobliżu Wysp Owczych U-Boot zatopił ogniem artyleryjskim zbudowany w 1931 roku farerski trawler „Emanuel” o pojemności 166 BRT, płynący z ładunkiem ryb z Islandii do Wielkiej Brytanii (na pozycji , na pokładzie śmierć poniosły trzy z liczącej osiem osób załogi). W dniach 10–20 maja okręt wchodził w skład wilczego stada „West”. 10 maja na południowy wschód od Grenlandii U-556 wziął udział w ataku stada na konwój , zatapiając dwa i uszkadzając jeden aliancki statek. O godzinie 04:42 okręt wystrzelił torpedy w kierunku dwóch statków, trafiając na pozycji zbudowany w 1938 roku brytyjski parowiec „Aelybryn” o pojemności 4986 BRT, przewożący 7935 ton drobnicy. Statek został uszkodzony i odholowany do Reykjavíku przez brytyjską korwetę , a w wyniku ataku zginęła jedna osoba. O 07:52 U-Boot storpedował zbudowany w 1919 roku brytyjski parowiec „Empire Caribou” (4861 BRT), przewożący 2020 ton kredy. Statek zatonął na pozycji , a w wyniku ataku zginęło 34 z liczącej 45 osób załogi (pozostałych uratował niszczyciel ).