Grzyby w glebie uzupełniają się z bakteriami. Bakterie to organizmy jednokomórkowe, które do przeżycia potrzebują warstwy wody, natomiast grzyby to organizmy wielokomórkowe, które rosną szybko i na duże odległości w glebie, dzięki czemu transportują składniki odżywcze na stosunkowo duże odległości. Grzyby glebowe odgrywają kluczową rolę w obiegu składników odżywczych w ekosystemach lądowych. Są szczególnie zaangażowane w obieg takich pierwiastków jak węgiel, azot i fosfor, ale odgrywają rolę w większości innych cykli pierwiastków w glebie. Wytwarzane przez grzyby kwasy organiczne lub siderofory, które rozpuszczają lub unieruchamiają niezbędne lub toksyczne metale, co ma konsekwencje zarówno dla ich własnego wzrostu, jak i wzrostu innych organizmów glebowych. Grzyby eukarpiczne odgrywają znaczącą rolę w fizycznym transporcie składników odżywczych z gleby poprzez translokację w obrębie grzybni, zwierając w ten sposób inne mechanizmy dyfuzji i transportu masy, zarówno w kontekście saprotroficznym, jak i mutualistycznym (mykoryzowym).