Aby dostać się do swojego pierwszego celu, Gao Fenga, chowającego się w Jaskiniach Maijishan, pozwala się pojmać i zabrać od siebie tzw. Puzdro Prekursorów, cywilizacji istniejącej przed ludźmi (Puzdro było ukazane w Assassin’s Creed: Rogue) dane jej przez Ezio. Shao uwalnia się i zabija Fenga. Następnie spotyka się w Makau z Wangiem Yangming, który zabił jednego z Tygrysów i planują zabić kolejnego, w ten sposób odzyskując Puzdro. Jun się to udaje, oddaje Puzdro Wangowi i ucieka z portu, który został podpalony przez templariuszy.
W 1529 roku Shao ściga i zabija Wei Bina, kolejnego z Tygrysów. Po jego śmierci dowiaduje się, że lider Tygrysów, Zhang Yong, wie o Puzdrze i ściga Wanga. Jun próbuje go uratować, ale nie udaje jej się to.
W 1530 roku Asasynka infiltruje Zakazane Miasto i odwiedza swoją przyjaciółkę z jej lat jako konkubina, . Okazuje się jednak, że templariusze zmusili Cesarzową do wprowadzenia Shao w pułapkę. Jun jej wybacza i ucieka z Miasta po zabiciu kolejnego Tygrysa, Qiu Ju.
W 1532 roku Mongołowie za pozwoleniem Yonga napadają na Chiny. Shao przybywa pod Wielki Mur i powstrzymuje ich, zamykając bramy. Ostatecznie konfrontuje się z Yongiem i go zabija. Dowiaduje się jednak, że Zhang już nie ma Puzdra, bo wysłał je poza teren kraju.