Zwierzęta gospodarskie i cały majątek zniszczonej wsi miały być wywiezione.
Według Grzegorza Motyki przyczyną pacyfikacji Kortelisów, Borków, Zabłocia i Borysówki było także ukrywanie Żydów.
„Czarna środa” w Kortelisach Zachował się raport dowódcy kompanii Nürnberg Oberleutnanta Glucksa z wykonania rozkazu, przechowywany w muzeum w Kortelisach. Według raportu wieś wraz z chutorami została otoczona kordonem policji 23 września 1942 roku o 4.35, a 5.30 rozpoczęła się pacyfikacja. Cała ludność wsi została zegnana do jej centrum pod pretekstem zebrania, a następnie zamknięta w cerkwi, szkole i innych pobliskich budynkach. Ofiary były nieświadome sytuacji i partiami konwojowane do pięciu miejsc egzekucji za wsią, gdzie wykopano już doły na zwłoki. Odgłos wystrzałów oprawcy zagłuszali zapuszczonymi silnikami samochodowymi. Po rozstrzelaniu mężczyzn rozstrzelano kobiety i dzieci. Egzekucja rozpoczęła się o 9.00, a zakończyła o 16.25.
Jak meldował Glucks, w czasie egzekucji zużyto 4321 nabojów, a kompania Nürnberg nie poniosła strat, jedynie jeden z kierowców doznał zapalenia żołądka.