Kariera Po ukończeniu studiów podjął pracę jako kapelmistrz w Operze w Kilonii, a następnie jako kapelmistrz w Oldenburgisches Staatstheater, gdzie dyrygował szerokim repertuarem operowym i symfonicznym. Od 2000 do 2013 roku był głównym dyrygentem Orchestra Camerata Italiana. W 2012 roku poprowadził światową premierę oratorium Cosimo Minicozziego La Passione di Padre Pio da Pietrelcina z Orchestra Camerata Italiana. W latach 2007–2010 był dyrygentem Erzgebirgische Philharmonie Aue (Eduard-von-Winterstein-Theater). W latach 2010–2013 był dyrektoremmuzycznym Międzynarodowego Festiwalu PuntaClassic z Orkiestrą Filharmoniczną Montevideo w Montevideo. W latach 2013–2016 był dyrygentem w Operze Wrocławskiej. W latach 2016–2017 pracował jako dyrygent w Operze Poznańskiej. W 2017 roku Matthias Manasi został dyrektorem muzycznym i głównym dyrygentem Nickel City Opera w Buffalo, (Nowy Jork, USA), którą to funkcję pełnił do 2021 roku. W latach 2020–2024 był głównym dyrygentem orkiestry „I Solisti di Milano” w Mediolanie.