Nakreślił również jej program: badanie metodą przyrodniczą, empiryczną i historyczną ludzkich społeczeństw, panującego w nich porządku i warunków postępu.
Wymienione dziedziny uporządkowane są według malejącego zakresu badań, od astronomii do socjologii (patrz. rycina), któremu towarzyszy wzrost złożoności badanych zjawisk. Kolejne mniej ogólne nauki, pojawiały się historycznie później, i później osiągały stadium empiryczne, przechodząc najpierw przez fazę teologiczną i metafizyczną.
Socjologia W projektowanym przez Comte'a systemie nauk znajdowała się również socjologia - nowa dyscyplina, zajmująca się społeczeństwem. Z tego powodu, Comte jest uznawany za ojca socjologii. Nowa nauka o społeczeństwie składać się miała z dwóch działów: statyki i dynamiki. Statyka obejmowała elementy stałe (związane z porządkiem), a dynamika zmienne (związane ze zmianą i postępem). Pierwsza obejmowała prawa współwystępowania, a druga następstwa. Comte zakładał, że porządek społeczny jest poznawalny, da się wyodrębnić od elementów dynamicznych. To, z czego składa się społeczeństwo i to jak się zmienia są dwoma odrębnymi obszarami badawczymi.