Wnętrze Dingli zaprojektował kościół na planie krzyża łacińskiego. Kościół składa się z nawy głównej, transeptu (nawy poprzecznej), prezbiterium (chóru kapłańskiego) z bogatym stropem, kopuły na skrzyżowaniu naw oraz dwóch zakrystii. Kościół ma 35 metrów długości i 7,6 metrów szerokości nawy, a rozpiętość transeptu to 26 metrów. Wnętrze kościoła jest w stylu doryckim. Główna apsyda i dwie boczne w obu krańcach transeptu, wraz z czterema łukami ołtarzy w nawie są ozdobione kolumnami i rzeźbione w stylu barokowym. Sklepiony sufit jest podzielony na ośmiokątne przestrzenie ze sztukateryjnymi rozetami pośrodku każdej przestrzeni. Ten sam typ dekoracji sztukatorskich można zobaczyć w konchach nad głównymi drzwiami, a sztukateria pokryta jest płatkowym złotem, co nadaje kościołowi bardzo bogaty wygląd. Cztery pendentywy ozdobione są postaciami czterech ewangelistów namalowanymi przez Josepha Briffę z Birkirkary w latach 60. ubiegłego wieku.