Dorobek naukowy Pierwsze prace Wernickego powstały pod wpływem Meynerta i dotyczyły neuroanatomii. Jako pierwszy przedstawił teoretyczne objawy wynikające z zakrzepu tętnicy móżdżkowej dolnej tylnej, potem potwierdzone klinicznie przez Wallenberga (zespół Wallenberga).
W wieku 26 lat opublikował swoją rozprawę o afazji, w której podjął próbę połączenia objawów afazji z różnymi ośrodkami mózgu i poparł zaproponowaną przez Daxa ideę dominacji jednej z półkul mózgowych.
Wybrane prace Strona tytułowa pracy Wernickego z 1874|thumb Das Verhalden der Pupillen bei Geisteskranken. (1872) Der aphasische Symptomenkomplex. Eine psychologische Studie auf anatomischer Basis. Breslau: M. Cohn & Weigert 1874 Erkrankungen der inneren Kapsel. Ein Beitrag zur Diagnose der Herderkrankungen. Breslau, 1875 Das Urwindungssystem des menschlichen Gehirns. (1876) Ein Fall von Ponserkrankung. (1877) Ueber das Bewusstsein. Allgemeine Zeitschrift für Psychiatrie 35, ss. 420-431 (1879) Ueber den wissenschaftlichen Standpunkt in der Psychiatrie. Kassel, 1880 Lehrbuch der Gehirnkrankheiten. Berlin: Theodor Fischer 1881/83 Band I. Berlin, 1881 Band II. Berlin, 1881 Band III. Berlin, 1883 Ueber einen Fall von secundärer Degeneration. Arch. f. Physiol. (1881) Ueber Aphasie und Anarthrie. Deutsche med. Wchnschr. 8, s.