Batalion de Limy powrócił do Rio de Janeiro, a on sam został awansowany na kapitana 22 stycznia 1824 roku.
Cztery miesiące po wybuchu wojny paragwajskiej, w marcu 1864 roku paragwajska armia wkroczyła na teren Argentyny, by stamtąd przypuścić atak na stan Rio Grande do Sul.
W międzyczasie w Rio Grande do Sul lokalni dowódcy nie byli w stanie przeciwstawić się paragwajskim oddziałom. Cesarz Piotr II, będąc świadomym zagrożenia ze strony Paragwajczyków, postanowił udać się na front, by wesprzeć walczących. De Lima, jako fligeladiutant cesarza, wyruszył razem z nim. Oddział cesarski dotarł do Uruguaiany we wrześniu 1865. Miasto znajdowało się wówczas pod paragwajską okupacją. W chwili, gdy de Lima i cesarz przybyli, zjednoczone oddziały brazylijskie i argentyńskie szturmowały Uruguaianę. Wkrótce wojska paragwajskie poddały się i opuściły miasto, zapobiegając dalszemu rozlewowi krwi i pozwalając Piotrowi II oraz de Limie wrócić do stolicy kraju. mały|De Lima w Paragwaju w 186610 października 1866 roku de Lima został mianowany nowym dowódcą zjednoczonych sił brazylijskich. Do Paragwaju przybył 18 listopada, czyli w czasie zawieszenia broni trwającego od października 1866 do lipca 1867 roku.