Szucha, ale niczego nie ujawniła i ostatecznie 25 sierpnia 1942 wywieziona została z Pawiaka, gdzie była przetrzymywana, do obozu Auschwitz-Birkenau, gdzie otrzymała nr 18279. W obozie próbowała organizować życie kulturalne, uczestnicząc w ruchu oporu. W styczniu 1943 została przekazana do obozu męskiego w Auschwitz, gdzie w tzw. 11 „bloku śmierci” przebywała do lipca. Ponownie przeniesiona do Birkenau, w którym pracowała w komandzie karnym z kilkudziesięcioosobowym zespołem młodych Żydówek przy segregowaniu odzieży po zagazowanych Żydach. W październiku 1944 przewieziona do Ravensbrück, gdzie otrzymała nr 80257. Została uwolniona 25 kwietnia 1945 i przewieziona przez Szwedzki Czerwony Krzyż do Szwecji na rehabilitację. 2 listopada 1945 powraca do Polski pierwszym transportem ewakuacyjnym.
Maria Maniakówna Rozkazem Nr 5/Pers. płk. Franciszka Kamińskiego, Komendanta Głównego BCh z 30 maja 1945 została odznaczona Krzyżem Srebrnym Orderu Wojennego Virtuti Militari. Odznaczenie zostało zweryfikowane 13 maja 1966 przez GKWO przy ZG ZBoWiD z nr. legitymacji DK-05626/W.