Pierwsze miesiące działalności w PAP Mając kłopoty w nawiązaniu kontaktu z lokalnymi ogniwami ZWZ w pierwszej połowie 1941 roku nawiązał współpracę z PAP. Został komendantem rejonu Kościerzyna (na początku 1943 roku przekształconej w Komendę Okręgu PAP) oraz otrzymał stopień organizacyjny kapitana. Zdołał utworzyć dużą sieć konspiracji PAP w powiecie kościerskim. Lesikowskiemu podporządkowały się m.in. oddziały partyzanckie Jana Szalewskiego ps. „Soból” (latem 1943 roku) oraz Stanisława Miszkiera. Na skutek szybkiego rozwoju PAP objęło zasięgiem swojej działalności wiele miejscowości na Pomorzu. Lesikowski jako członek PAP był zaangażowany w działalność wywiadowczą.
Akcje dywersyjne na Pomorzu Lesikowski zorganizował kilka udanych akcji bojowych na Pomorzu. Zasłynął przede wszystkim z przeprowadzenia akcji dywersyjnej na linii kolejowej Chojnice–Tczew w nocy z 8 na 9 czerwca 1942. Na skutek rozkręcenia torów doszło do wykolejenia pociągu pośpiesznego relacji Berlin–Królewiec w rejonie leśniczówki Cis w przysiółku Trzosowo w pobliżu Zblewa. W akcji uczestniczyły oddziały Szalewskiego (w innym źródle Jan Szalewski jest wymieniany jako współorganizator akcji) i Miszkiera. Przerwa w ruchu pociągów spowodowana wykolejeniem pociągów trwała niecałą dobę.