2, Poznań 2006. s. 17.

Dorobek naukowy Ks. Nowacki opublikował 84 praceKs. M. Banaszek, Ksiądz Józef Nowacki – historyk kościoła w Polsce (Pośmiertne wspomnienia o działalności naukowej i pedagogicznej), W: J. Nowacki, Dzieje Archidiecezji poznańskiej, t. 2, Poznań 1964, s. 967.. Z najwcześniejszych jego dzieł, nie licząc kilkudziesięciu przyczynków naukowych opublikowanych przed rokiem 1939, w tym między innymi o biskupie gnieźnieńskim Januszu i nieznanym synodzie prowincjonalnym z roku 1258, na szczególną uwagę zasługują dwie ważne monografie: „Opactwo św. Gotarda w Szpetalu pod Włocławkiem zakonu Cysterskiego (ok. 1228-1285-1358). Przyczynek do misji pruskiej biskupa Chrystiana” https://bazhum.muzhp.pl/media/texts/collectanea-theologica/1935-tom-16-numer-1/collectanea_theologica-r1935-t16-n1-s127-129.pdf (1934) oraz opracowane w języku łacińskim obszerne studium pt.: „De archiepiscopi Gnesnensis dignitate ac praerogativa primatiali"https://bazhum.muzhp.pl/media/texts/collectanea-theologica/1937-tom-18-numer-3-4/collectanea_theologica-r1937-t18-n3_4-s616-700.pdf, opublikowane we Lwowie w „Collectanea Theologica" w roku 1937F. Lenort, Josepho Nowacki post obitum anno quadragesimo, W: Ecclesia. Studia z dziejów Wielkopolski, F. Lenort (red.), t. 2, Poznań 2006. s. 19.. Ks.