W 1959 roku Władysław Nikiciuk, podopieczny trenera Bronisława Gurzędy, ustanowił w Krakowie rekord świata juniorów w rzucie oszczepem (79,12 m). Był to największy sukces w historii regionalnej lekkoatletyki. Dwukrotnie startował w igrzyskach olimpijskich: w Tokio w 1964 był dziewiąty (73,11), a w Meksyku w 1968 uplasował się tuż za podium zajmując 4. miejsce i uzyskując wynik 85,70. W 1962 roku sięgnął po brąz, a w 1966 po srebro mistrzostw Europy. W latach 60. barwy Jagiellonii reprezentowały też czołowe polskie biegaczki: Teresa Jędrak i Krystyna Hryniewicka (później Kacperczyk), które startowały w meczach międzypaństwowych oraz mistrzostwach Europy. Trenerem obu zawodniczek był Zbigniew Dondziłło – obok Gurzędów kluczowa postać w rozwoju lekkoatletycznej sekcji Jagiellonii. W latach 80. wielkim talentem okazał się Jerzy Mydlarz, medalista mistrzostw Polski w biegach średniodystansowych na 1,5 i 3 km. W gronie medalistów mistrzostw Polski znaleźli się m.in.: Danuta Zrajkowska (rzut dyskiem), Dariusz Zielenkiewicz (400m), W 1992 roku dwóch zawodników Jagiellonii – kulomiotka Krystyna Danilczyk (Zabawska) i trójskoczek Eugeniusz Bedeniczuk – wystartowało na igrzyskach olimpijskich w Barcelonie. Współpracowali oni z trenerem Henrykiem Olszewskim. W latach 90.