Czernikowo – wieś w Polsce położona w województwie kujawsko-pomorskim, w powiecie toruńskim, w gminie Czernikowo, której jest siedzibą.
W latach 1954–1972 wieś należała i była siedzibą władz gromady Czernikowo. W latach 1975–1998 miejscowość administracyjnie należała do województwa włocławskiego.
Według Narodowego Spisu Powszechnego (III 2011 r.) liczyła 3038 mieszkańców. Jest największą miejscowością gminy Czernikowo.
Czernikowo położone jest na ziemi dobrzyńskiej.
Części wsi +Integralne części wsi Czernikowo SIMC Nazwa Rodzaj 0861529 Kępiacz kolonia1031385 Zajączkowo część wsi1031391 Zygmuntowo część wsi1031400 Żabowo część wsi
Historia Dzieje Czernikowa są nieodłącznie związane z historią terenu, na którym leży, czyli Ziemi Dobrzyńskiej. Pierwsza wzmianka o wsi pochodzi z 1309 roku, lecz prawdopodobnie miejscowość istniała już wcześniej. Od XIV wieku aż do rozbiorów Polski Czernikowo wchodziło w skład województwa inowrocławskiego Korony Królestwa Polskiego. W 1366 roku podczas pożaru spłonął drewniany kościół pw. św. Mikołaja, na którego miejscu wybudowano gotycką świątynię. Kościół zachował gotyckie fundamenty oraz barokowe wnętrze.