5 maja 1919 roku objął stanowisko kierownika szkoły sanitarnej przy batalionie sanitarnym, a z czasem został komendantem batalionu sanitarnego, który miał kilka garnizonów (Góra Kalwaria, Warszawa, Zegrze, Modlin). W 1920 roku pełnił obowiązki lekarza wojskowego i dowódcy szpitala w Jarosławiu. 1 maja 1921 roku Feliks Hahn został przeniesiony w stan spoczynku z równoczesnym awansem na stopień pułkownika w Korpusie Lekarskim.
Praktyka cywilna we Lwowie Po przejściu na emeryturę wojskową, Feliks Hahn osiedlił się na stałe z rodziną we Lwowie. Mieszkał kolejno przy ul. Grodeckiej 46, ul. Cetnarowskiej 35, a pod koniec lat 30. przy ul. Kadeckiej 7. Przez całe dwudziestolecie międzywojenne prowadził prywatną praktykę lekarską jako internista, specjalista chorób płuc i serca. W ogłoszeniach z 1925 roku informował o oferowaniu prześwietleń rentgenem oraz leczenia lampą Sollux i lampą kwarcowąDziennik Ludowy Nr 100 Rok IX z dnia 3 maja 1926.. Wśród jego pacjentów był m. in. Maksymilian Goldstein (1880–1942), założyciel Muzeum Żydowskiego we Lwowie, bankowiec i kolekcjoner judaików.