pełniąc dalej służbę na stanowisku szefa szkolenia Komendy Portu Wojennego Gdynia. W okresie od 28 października 2010 r. do 20 kwietnia 2011 r. wykonywał zadania w ramach VIII zmiany Polskiego Kontyngentu Wojskowego w Afganistanie, po czym po misji dalej pełnił służbę w Komendzie Portu Wojennego Gdynia na stanowisku szefa szkolenia.
W 2011 r. został wyznaczony na stanowisko służbowe Komendanta Garnizonu Gdynia, gdzie sprawował tę funkcję do 31 grudnia 2012 r. Z początkiem 2013 r. objął stanowisko w Dowództwie Marynarki Wojennej. 15 sierpnia 2013 r. kmdr por. Jarosław Wypijewski został uhonorowany przez prezydenta RP Bronisława Komorowskiego na dziedzińcu Belwederu w Warszawie Morskim Krzyżem Zasługi z Mieczami. 26 listopada 2013 r. został skierowany po raz czwarty do wykonywania zadań poza granicami kraju, w ramach XIV zmiany w Polskim Kontyngencie Wojskowym w Afganistanie, gdzie pełnił służbę do 5 czerwca 2014 r.. Na wszystkich czterech misjach łącznie odbył ponad 500 patroli poza bazą wojskową. W czerwcu 2014 r., po misji w Afganistanie otrzymał przydział służbowy do DG RSZ, pełniąc obowiązki szefa wydziału bazy szkoleniowej. 16 lutego 2015 r. objął obowiązki Zastępcy Komendanta – Szefa Sztabu Komendy Portu Wojennego Gdynia.