Wśród wykładowców znaleźli się, oprócz już wymienionych, Celio Calcagnini, matematyk, literat, poeta i filozof, Andrea Alciato, prawnik z Mediolanu, który został wezwany do Ferrary, oraz Antonio Musa Brassavola, autor „Examen Omnium Simplicium Medicamentorum”, podstawowego dzieła z zakresu badań botanicznych tamtych czasów, opisującego ponad dwa tysiące roślin i ich względne właściwości lecznicze.
W 1598 roku Uniwersytet znalazł się pod wpływami papieskimi w Państwie Kościelnym.
Okres napoleoński
Wydarzenia historyczne końca XVIII wieku, po rewolucji francuskiej, nadały nowy impuls uniwersytetowi. W 1797 roku samorządy lokalne zostały zastąpione przez rząd Republiki Cispadańskiej, która połączyła się z Republiką Cisalpińską. Jednym z pierwszych posunięć wprowadzonych przez ten nowy rząd centralny było utworzenie katedry „Prawa Konstytucyjnego Cispadańskiego i Powszechnego Prawa Publicznego”, pierwszej w Europie. Katedrę powierzono księdzu, don Giuseppe Compagnoniemu z Lugo, sekretarzowi rządu, który zaproponował kolory zielony-biały-czerwony dla flagi republiki.
XX i XXI wiek