W lutym 2025 roku w oficjalnych doniesieniach pojawiła się informacja o opóźnieniu projektu o ok. 3-5 lat z powodu problemów ze statecznością konstrukcji przy małych prędkościach, podwoziem oraz usterzeniem. Ministerstwo zdementowało informacje o jego likwidacji, potwierdzając jednak istnienie znaczących trudności konstrukcyjnych. 10 marca 2025 roku ogłoszono przetarg na prowadzenie dalszych prac badawczo-rozwojowych nad samolotem LMS-901. Jedynym beneficjentem postępowania została firma Bajkał Engineering. Zgodnie z warunkami przetargu zakończenie prac badawczych przewidziano na 17 grudnia 2027 roku. Jednocześnie obniżono wymagania techniczne i osiągi samolotu. Prędkość przelotową zmniejszono z 300 km/h do 250 km/h, natomiast zasięg z 1500 km z ładunkiem 2000 kg ograniczono do 745 km przy ładunku 1500 kg. W nowych wymaganiach pominięto również docelową cenę samolotu, która prawdopodobnie będzie znacząco wyższa niż deklarowana w 2019 roku.