Od lutego 1927 pełnił służbę w batalionie sztabowym MSWojsk.

1 marca 1929 Wojskowy Sąd Okręgowy Nr I w Warszawie w składzie: major Korpusu Sądowego Karol Ludwik Sożyński (przewodniczący), i major Andrzej Strach oraz kapitanowie Feliks Gwiazda, Stanisław Pisanecki i Stefan Jellenta (asesorzy), skazał go za występek przywłaszczenia na karę łączną dziewięciu miesięcy więzienia i wydalenie z wojska. Na poczet orzeczonej kary zaliczono mu pobyt w areszcie śledczym od 14 stycznia do 6 kwietnia 1928 (w tym czasie pozostawał w dyspozycji dowódcy Okręgu Korpusu Nr I).

29 marca 1929 wyrok uprawomocnił się po uprzednim odrzuceniu zażalenia przez Najwyższy Sąd Wojskowy. 11 września 1929 prezydent RP w drodze łaski złagodził wymierzoną mu karę pozbawienia wolności do sześciu miesięcy więzienia z utrzymaniem w mocy zaliczenia aresztu śledczego oraz zamienił orzeczoną karę dodatkową na czci na karę wydalenia z korpusu oficerskiego. 10 października 1929 szef Biura Personalnego Ministerstwa Spraw Wojskowych, pułkownik dyplomowany Bohdan Hulewicz, działajac w imieniu ministra spraw wojskowych, zarządził zwolnienie porucznika Stanisława III Mikulskiego ze służby czynnej, skreślenie go z list oficerskich i zwolnienie przez właściwą powiatową komendę uzupełnień z obowiązku wosjkowego. Zarządzenie szefa Biura Personalnego MSWojsk.