Jednocześnie dekret przyznawał Zakładom uprawnienia kontrolne wobec hodowli prywatnych i spółdzielczych, a także wobec obrotu nasionami prowadzonego przez te podmioty.
Wprowadzenie państwowego nadzoru nad prywatną i spółdzielczą działalnością hodowlaną miało na celu zapewnienie jednolitych standardów jakościowych oraz podporządkowanie produkcji nasiennej ogólnym założeniom polityki rolnej państwa.
Istotnym elementem działalności Zakładu było rozmnażanie nasion zarówno własnych, jak i pochodzących z obcych hodowli. Proces ten realizowany był w wyspecjalizowanych ośrodkach państwowych oraz w gospodarstwach prywatnych na podstawie umów plantacyjnych. Zastosowanie systemu umów plantacyjnych umożliwiało włączenie rolników indywidualnych w państwowy system produkcji nasiennej przy jednoczesnym zachowaniu kontroli nad technologią uprawy i jakością uzyskanego materiału siewnego. Zakład pełnił w tym zakresie funkcję koordynującą i nadzorczą, odpowiadając za organizację produkcji oraz odbiór nasion spełniających określone normy.