Nieopodal Baranowa linia miała przeciąć budowaną specjalnie na olimpiadę w Moskwie w 1980 roku drogę tzw. Olimpijkę, która miała połączyć Berlin z Moskwą przez Warszawę. Wybudowano tu filary, które zostały zburzone w czasie budowy w 2010 roku odcinka autostrady A2. W ramach budowy A2 w miejscu przecięcia linii z autostradą powstał wiadukt w ciągu autostrady.
Dalej linia nr 5 miała w Teresinie krzyżować się z linią kolejową nr 3, planowano w tym rejonie budowę dwóch łącznic umożliwiających pociągom zjazd z CMK w kierunku: zachodnim (Regów – Szymanów) oraz wschodnim (Regów – Błonie). Współczesne trasowanie, związane z planami budowy Centralnego Portu Komunikacyjnego w Baranowie oraz nową linią kolejową nr 85 z Ożarowa Mazowieckiego i Warszawy Gołąbek do Poznania przez Łódź, zakłada budowę czterech łącznic z przecięciem się CMK Północ z linią nr 3 w rejonie Piasecznicy oraz zakończenie linii kolejowej nr 88, biegnącej obok niej.
Następnie linia miała omijać Kampinoski Park Narodowy przez Wyszogród, gdzie zakładano również budowę mostu przez Wisłę. Rozważano budowę dwupoziomowego mostu kolejowo-drogowego.