Układem sprawiającym najwięcej problemu była instalacja elektryczna, a szczególnie falowniki.

W październiku 2005 EN81-001 został wypożyczony przez producenta na targi Trako w Gdańsku.

6 lipca 2006 województwo małopolskie podpisało z konsorcjum firm Pesa i BRE Leasing (obecnie mLeasing) umowę na 10-letni leasing kolejnych 4 egzemplarzy EN81 wraz z 2 egzemplarzami spalinowych SA133. Umowa ta przewidywała możliwość wykupu pojazdów po zakończeniu leasingu. Pierwszy EN81 i pierwszy SA133 dostarczono 21 lutego 2007. Pojazdy zostały wynajęte również w celu obsługi krakowskiego węzła kolejowego, dzięki nim awaryjne SA109 można było przenieść na linię Sucha Beskidzka – Żywiec. W 2016 roku, po zakończeniu leasingu, zarząd województwa podjął decyzję o niewykupywaniu leasingowanych EN81. Pozostałe 2 EN81 będące własnością województwa były wówczas odstawione w Suchej Beskidzkiej ze względu na brak naprawy P4 i województwo chciało je sprzedać.