Po przekazaniu Hongkongu Chinom w 1997 roku przyjęto obecną nazwę Hong Kong Observatory, a instytucja została włączona w struktury administracji regionu specjalnego. Mimo zmian politycznych zachowała ciągłość działalności i nadal rozwijała swoje kompetencje, m.in. w zakresie nowoczesnych technologii meteorologicznych i monitorowania środowiska.
Funkcje i działalność Głównym zadaniem Hong Kong Observatory jest prognozowanie pogody oraz wydawanie ostrzeżeń przed niebezpiecznymi zjawiskami atmosferycznymi, takimi jak tajfuny, ulewy czy burze. Instytucja prowadzi całodobowy monitoring warunków meteorologicznych, wykorzystując sieć automatycznych stacji pomiarowych, radarów dopplerowskich oraz systemów satelitarnych. Obserwatorium świadczy usługi dla różnych sektorów gospodarki, w tym żeglugi, lotnictwa i infrastruktury krytycznej. Opracowuje także prognozy długoterminowe i analizy klimatyczne oraz prowadzi badania nad zmianami klimatu i ich wpływem na region. W kolejnych dekadach zakres działalności instytucji rozszerzono o monitorowanie promieniowania, rozwój systemów ostrzegania przed katastrofami naturalnymi oraz współpracę międzynarodową w ramach Światowej Organizacji Meteorologicznej.