W 1929 roku Kettunen został mianowany profesorem języków fińskich na Uniwersytecie Helsińskim. Stanowisko to piastował do 1938 roku. Na początku 1939 roku stanowisko to zostało przekształcone w katedrę języka estońskiego i języków pokrewnych. Kettunen przeszedł na emeryturę w 1953 roku. Podczas bezpłatnego urlopu pracował jako wykładowca na Królewskim Węgierskim Uniwersytecie im. Pétera Pázmány’ego w Budapeszcie w latach 1935–1937 oraz 1941–1944. mały|Profesorowie Wydziału Filozofii Uniwersytetu w Tartu na początku lat 20. XX wieku (Lauri Kettunen siedzi pierwszy po prawej stronie) Lauri Kettunen uczestniczył w działalności Towarzystwa Badań nad Językiem Fińskim, Towarzystwa Finno-Ugryjskiego oraz Towarzystwa Literatury Fińskiej. Był jednym z założycieli Estońskiego Towarzystwa Języka Ojczystego, utworzonego w 1920 r., i pełnił funkcję jego przewodniczącego w latach 1920–1924. W 1959 roku Kettunen otrzymał Nagrodę Fińskiej Akademii Nauk (500 000 marek) w uznaniu jego zasług jako badacza języków fińskich.