4 lipca 2009 podczas święta brygady otrzymał przydział służbowy na stanowisko dowódcy 1 batalionu piechoty zmotoryzowanej im. płk. dypl. Beniamina Piotra Kotarby z 17 WBZ w Międzyrzeczu wraz z awansem na stopień podpułkownikaPowiatowa Miesięcznik Niezależny Międzyrzecz nr 8 Sierpień 2009 s. 8.. Od 20 kwietnia 2011 ppłk Tomasz Biedziak pełnił służbę w Afganistanie w ramach IX zmiany jako dowódca Zgrupowania Bojowego „Bravo” do 26 października 2011Kurier Międzyrzecki nr 7 Lipiec 2011 s. 35.. W dniach 7–8 lutego 2012 podczas odprawy rozliczeniowo-koordynacyjnej Wojsk Lądowych gen. broni Zbigniew Głowienka wyróżnił tytułem „Przodujący Pododdział” 1 batalion piechoty zmotoryzowanej 17 Wielkopolskiej Brygady Zmechanizowanej, dowodzony przez ppłk. Tomasza Biedziaka.
Od lutego 2012 służba na stanowisku szefa szkolenia 10 Brygady Kawalerii Pancernej w Świętoszowie. 26 listopada 2013 został skierowany ponownie do Afganistanu, gdzie w ramach XIV zmiany wykonywał zadania na stanowisku zastępcy dowódcy Polskiego Kontyngentu Wojskowego. 5 maja 2014 po misji powrócił do Świętoszowa, gdzie dalej pełnił służbę na stanowisku szefa szkolenia 10 BKPanc. W 2015 ukończył Wyższy Kurs Operacyjno – Strategiczny w AON.