tam poznał prezydenta Williama McKinleya, który, dostrzegając zdolności biznesowe Hitchcocka, mianował go w sierpniu 1897 posłem nadzwyczajnym w Rosji, dla rozwoju handlu między Stanami Zjednoczonymi a Cesarstwem. 11 lutego 1898 Hitchcock został wyniesiony do rangi ambasadora. Efektem jego pracy był znaczny wzrost amerykańskiego eksportu do Imperium. Podczas wojny amerykańsko-hiszpańskiej informował dwór carski i przebywających w Petersburgu dyplomatów o postępach na froncie.
21 grudnia 1898 Hitchcock otrzymał od prezydenta McKinleya telegraficzną propozycję objęcia kierownictwa nad Departamentem Zasobów Wewnętrznych, w miejsce , który zrezygnował. Hitchcock przyjął nominację; jednak do Waszyngtonu wrócił dopiero dwa miesiące po zatwierdzeniu jego kandydatury przez Senat. Po zamachu na McKinleya w 1901 pozostał na stanowisku w gabinecie Theodore'a Roosevelta.
mały|Hitchcock (czwarty z prawej) z członkami gabinetu Roosevelta (1903)|lewoJako sekretarz angażował się w sprawy Indian amerykańskich, udzielając pomocy plemionom i reorganizując administrację z nimi związaną. Wdrożył program ochrony zasobów naturalnych i walczył z korupcją.