Miroslav Koubek (ur. 1 września 1951 w Pradze) – czeski trener piłkarski, grający wcześniej jako bramkarz, w latach 2025–2026 selekcjoner reprezentacji Czech.
Kariera trenerska Koubek trenował kilka czeskich klubów. Poprowadził SK Kladno do tytułu mistrza drugiej ligi czeskiej w sezonie 2005/2006, zapewniając klubowi powrót do najwyższej klasy rozgrywkowej po raz pierwszy od 1970 roku. W sezonie 2008/2009 poprowadził Zenit Čáslav do drugiego miejsca w drugiej lidze czeskiej i awansu do pierwszej ligi, chociaż Čáslav ostatecznie sprzedał licencję pierwszej ligi rywalom i pozostał w drugiej lidze. Koubek dołączył do Baníka Ostrava w czerwcu 2009 roku, prowadząc ich do trzeciego miejsca w pierwszej lidze czeskiej 2009/2010. Sezon 2010/2011 rozpoczął się jednak od mizernych wyników dla Baníka, klub przegrał siedem z pierwszych 13 meczów, a Koubek został zwolniony w październiku.