Uczestniczyła w pracach ogólnokrajowej Komisji powołanej przez Ministerstwo Kultury i Sztuki, której celem była korekta programów nauczania muzycznego na poziomie szkolnictwa podstawowego i średniego. Zasiadała w jury konkursów pianistycznych, wygłaszała wykłady metodyczne oraz prowadziła ogólnopolskie seminaria i warsztaty dla nauczycieli oraz uczniów szkół muzycznych.
Metoda autorska i publikacje Maria Niemira opracowała metodę rozwijania techniki pianistycznej opartą na specjalistycznych ćwiczeniach bezklawiaturowych (fizycznych ćwiczeniach palców, dłoni i przedramion). Miały one na celu optymalizację kondycji aparatu ruchu oraz zapobieganie przeciążeniom i kontuzjom zawodowym. Koncepcja ta stanowiła syntezę jej doświadczeń pedagogicznych oraz analizy wskazówek J.S. Bacha, F. Chopina, F. Liszta oraz H. Neuhausa.
Swoje założenia opublikowała w podręczniku Jak zdobyć, rozwijać i utrzymać technikę pianistyczną, który doczekał się czterech wydań krajowych:
I wydanie: 2002 (Bydgoszcz: wydawnictwo Margrafsen) II wydanie: 2004 (Warszawa: wydawnictwo Twoja Muza, poprawione i uzupełnione o dokumentację fotograficzną, 336 stron) III wydanie: ok.