Wypromował 11 doktorów oraz wielokrotnie pełnił rolę recenzenta w postępowaniach awansowych (34 recenzje prac doktorskich i habilitacyjnych).
Dorobek publikacyjny Jest autorem oraz współautorem obszernego dorobku naukowego, na który składa się m.in.:
Ok. 350 oryginalnych prac twórczych oraz 250 prac przeglądowych, publikowanych głównie w czasopismach znajdujących się na liście filadelfijskiej. Ok. 210 artykułów popularnonaukowych. 7 podrążników i książek naukowych z zakresu immunologii, mikrobiologii i chlamydiologii, w tym dwóch pierwszych w Polsce podręczników z immunologii zwierząt (Immunologia zwierząt, UJ Kraków 1998 oraz PWN Poznań 2000) i opracowania z chlamydiologii (US 2012). 8 skryptów akademickich (w tym dydaktycznego opracowania Immunologia dla biologów). 15 opracowań zwartych, w tym monografii dotyczących organizacji nauki, historii środowiska naukowego oraz filozofii.
Odznaczenia, wyróżnienia i członkostwo Profesor Deptuła został uhonorowany najwyższymi odznaczeniami polskich towarzystw naukowych: