Wstąpienie do stanu duchownego było wówczas dla uzdolnionego ucznia jedynym sposobem na uzyskanie dostępu do szkolnictwa wyższego. Imperium Osmańskie pozostawiło bowiem Kościołowi troskę o kształcenie ludności greckiej.

Studia uniwersyteckie na Zachodzie mały|alt=obraz: portret łysiejącego mężczyzny siedzącego w fotelu, z piórem w dłoni|Adamandios Korais Na studia do Europy Zachodniej wyjechał wraz z Benjaminem z Lesbos. Pobyt sfinansowali jego wuj Sofronios Kampanakis oraz kilku bogatych mieszczan-kydoniatów (tak nazywano mieszkańców Kydonies). Dokładna data wyjazdu nie jest znana: zachowana lista subskrybentów, którzy zobowiązali się pokryć koszty jego nauki w Europie, nosi datę 13 lutego 1806, a Kairis mógł wówczas jeszcze nie opuścić Kydonies.

W Pizie studiował głównie nauki fizyczne i matematykę. Według zachowanych świadectw, datowanych na sierpień 1807, uczęszczał przez dwa lata na matematykę i przez rok na astronomię. Uczęszczał też na wykłady z filozofii oraz na przeznaczone dla studentów medycyny wykłady z fizjologii, choć sama medycyna go nie interesowała. Wydaje się, że jego intelektualnym dążeniem było wówczas poszukiwanie prawdy naukowej, która mogłaby odpowiedzieć na jego duchowe wątpliwości.