Miało jej to prawdopodobnie umożliwić kontynuowanie kariery akademickiej.
Wczesne lata mały|skala=0.6|Margaret Maltby (w środku) z siostrami Betsy Mayhew (z domu Maltby) i Marthą Jane Maltby, 1892|alt=Sepiowa fotografia gabinetowa trzech kobiet w ciemnych, zapinanych pod szyję sukniach, ujętych w owalnej winiecie. Kobieta po lewej patrzy w obiektyw, młodsza w środku wychyla się zza jej ramienia, trzecia po prawej jest widoczna z profilu i spogląda w dół. Na tekturce nadruk zakładu fotograficznego „Upton, Oberlin, O.”|left Margaret Maltby urodziła się 10 grudnia 1860 roku na rodzinnej farmie w Bristolville w stanie Ohio jako Minnie Eliza Maltby, córka Edmunda Maltby’ego i Lydii Jane Brockway. Miała dwie starsze siostry, Betsy i Marthę Jane, które w chwili jej narodzin miały trzynaście i piętnaście lat. Imię Minnie nadały jej siostry, ale go nie lubiła i w 1889 roku zmieniła je na Margaret.
Maltby od młodych lat interesowała się nauką i matematyką, a rodzice zachęcali ją do rozwijania tych zainteresowań. Nauczyli ją obsługi prostych urządzeń, a ojciec szczególnie wspierał jej zamiłowanie do matematyki. Po śmierci Edmunda Maltby’ego rodzina Maltbych przeniosła się do Oberlin ze względu na możliwości edukacyjne.