Pod koniec stulecia Franz Kirzinger wykonał nowy ołtarz główny poświęcony św. Marcinowi oraz obrazy dla ołtarzy bocznych.
Klasztor został zlikwidowany w 1803 roku, w okresie sekularyzacji. Placówka liczyła wówczas 18 kanoników. Kościół klasztorny przekształcono w kościół parafialny, część zbiorów biblioteki trafiła do Biblioteki Dworskiej, a później do Bawarskiej Biblioteki Państwowej. W 1810 roku kompleks nabył graf lgnaz Arco. W następnych latach obiekt kilkukrotnie zmieniał właściciela, w 1852 roku zakupił go August von Wendland, który rozebrał wschodnie i zachodnie skrzydło klasztorne, a południowe skrzydło przebudował na neorenesansowy pałac. Ogród klasztorny przekształcono na ogród w stylu angielskim według projektu i jego syna, . W 1912 roku w kościele zainstalowano organy wykonane przez warsztat Behler.