Na zewnątrz kościół otrzymał wieżę oraz pięć kopuł, które wyraźnie zmieniły jego pierwotną późnobarokową sylwetę.
Przebudowa na cerkiew była pierwszym z szeregu przekształceń, które stopniowo zacierały pierwotny wygląd świątyni. W następnych dziesięcioleciach usunięto znaczną część jej wystroju architektonicznego.
Przekształcenia w XX wieku
Po odzyskaniu przez Polskę niepodległości obiekt przestał pełnić funkcję cerkwi. W 1921 roku przestrzeń dawnego kościoła podzielono stropem na dwie kondygnacje, co zasadniczo zmieniło proporcje pierwotnego wnętrza.
Zespół nadal był wykorzystywany do celów świeckich i wojskowych. Zmiany wprowadzone w XIX i pierwszej połowie XX wieku doprowadziły do niemal całkowitego zatarcia sakralnego charakteru wnętrza kościoła.
W latach 60. XX wieku rozważano rozbiórkę zabudowań powizytkowskich, ostatecznie jednak zdecydowano się na ich zachowanie i adaptację. W latach 1970–1979 przeprowadzono przebudowę zespołu na cele kulturalne według projektu Kazimierza Kwiatkowskiego i Tadeusza Michalaka.
W 1991 roku działające w kompleksie instytucje kulturalne zostały połączone w Centrum Kultury w Lublinie.
Renowacja w XXI wieku