6 listopada Zugdidi – ostatni bastion zwolenników Gamsachurdii – padło niemal bez walki. Resztki sił wiernych Gamsachurdii rozproszyły się w lasach rejonu Calendżicha, a sam obalony prezydent zaczął się ukrywać. W grudniu Gamsachurdii coraz trudniej było unikać rządowych oddziałów prowadzących poszukiwania. 31 grudnia zmarł w niewyjaśnionych okolicznościach we wsi Dzweli Chibula w górzystym regionie Megrelii. Według właściciela domu, w którym przebywał, popełnił samobójstwo, strzelając sobie w głowę z pistoletu. Jednak obecność otworu po kuli w tylnej części głowy dała początek teorii, jakoby został zamordowany. O zamordowanie Gamsachurdii oskarżano Eduarda Szewardnadzego.
W wywiadzie udzielonym w 2009 roku dziennikowi „Wriemia Nowostiej” były premier Gruzji Tengiz Sigua wspomniał o jeszcze jednej teorii dotyczącej śmierci – otruciu:
Śmierć Zwiada Gamsachurdii oznaczała koniec wojny domowej w Gruzji; pozostałe oddziały partyzanckie zostały zlikwidowane w ciągu kolejnych miesięcy zimy i wczesną wiosną 1994 roku.